Quellcode-Paket openbabel herunterladen:
Open Babel ist ein Chemiekasten, konzipiert, um die vielen Sprachen chemischer Daten zu sprechen. Es erlaubt die Suche, Konvertierung, Analyse oder Speicherung von Daten aus der molekularen Modellierung, Chemie, Festkörpermaterialien, Biochemie oder ähnlichen Gebieten. Einige Eigenschaften:
* Anheften und Entfernen von Wasserstoff * Unterstützung für molekulare Mechanik * Unterstützung für SMARTS molekulare Abgleichsyntax * Automatische Erkennung und Anzeige der Eigenschaften (Ringe, Bindungen, Hybridisierung, Aromatizität) * Flexible Atomzuordnung und Erkennung von multiplen Verbindungen der Atomkoordinaten * Berechnung der Partialladung nach Gasteiger-Marsili
Open Babels Dateiformatunterstützung umfasst: PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL, Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC und MPQC.
Dieses Paket enthält die folgenden Werkzeuge:
* babel: Konverter zwischen verschiedenen Chemiedateiformaten * obenergy: Berechnet die Energie einzelner Moleküle * ebminimize: Optimiert die Geometrie eines Moleküls so, dass die Energie minimal wird * obgrep: SMARTS-Muster verwendendes Molekül Suchprogramm * obprop: Gibt die standard Moleküleigenschaften aus * obfit: Überlagert zwei Moleküle anhand eines Musters * obrotamer: Generiert Konformere/Rotamer-Koordinaten * obchiral: Gibt die Chiralität von Molekülen aus * obrotate: Rotiert den Raumwinkel der Moleküle, im Batch-Betrieb
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| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| alpha | 2.2.3-1 | 127,1 kB | 524 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 2.2.3-1 | 122,7 kB | 480 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 2.2.3-1+b1 | 111,5 kB | 420 kB | [Liste der Dateien] |
| hppa | 2.2.3-1 | 124,1 kB | 444 kB | [Liste der Dateien] |
| hurd-i386 | 2.2.3-1 | 115,3 kB | 428 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 2.2.3-1 | 118,1 kB | 428 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 | 2.2.3-1+b1 | 146,3 kB | 604 kB | [Liste der Dateien] |
| kfreebsd-amd64 | 2.2.3-1 | 123,3 kB | 406 kB | [Liste der Dateien] |
| kfreebsd-i386 | 2.2.3-1 | 117,5 kB | 352 kB | [Liste der Dateien] |
| m68k (inoffizielle Portierung) | 2.2.1-1 | 221,2 kB | 532 kB | [Liste der Dateien] |
| mips | 2.2.3-1 | 117,5 kB | 464 kB | [Liste der Dateien] |
| mipsel | 2.2.3-1 | 117,1 kB | 464 kB | [Liste der Dateien] |
| powerpc | 2.2.3-1 | 138,1 kB | 508 kB | [Liste der Dateien] |
| s390 | 2.2.3-1 | 119,0 kB | 432 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc | 2.2.3-1 | 118,8 kB | 428 kB | [Liste der Dateien] |