Paket: mozilla-biofox (1.1.5-1)

Erweiterung für Bioinformatikwerkzeuge für Iceape- und Iceweasel-Browser

Code bioFOX hat sich zum Ziel gesetzt, diverse Bioinformatikwerkzeuge als eine Erweiterung für Iceape- und Iceweasel-Browser bereitzustellen. Die Analyse Ihrer bevorzugten Gene erfordert es für gewöhnlich, sie aus einer Datenbank wie dem NCBI oder Swiss-Prot abzufragen und dann eine oder mehrere Aufgaben darauf anzuwenden. Darunter befinden sich unter anderem folgende Aufgaben:

 * Translation einer Nukleotidsequenz;
 * Suche der gewünschten Nukleotid-/Proteinsequenz in Blast (z.B. blastn,
   blastp, ...);
 * Berechnung der Eigenschaften (wie PI, Ladung, Molekulargewicht,
   AT/GC-Gehalt, usw.) einer Protein- oder Nukleotidsequenz;
 * Konvertierung zwischen verschiedenen Formaten (Genbank, Fasta,
   Swiss-Prot, usw.);
 * Vorhersage der Sequenz für subzellulare Lokalisierung (PREDOTAR,
   TargetP, pSORT, usw.).

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Ahnenforschung, Benutzer-Schnittstellen: World Wide Web, X Window-System, Rolle: Erweiterung, Zweck: Hilfswerkzeug, Anwendungs-Suite: Mozilla, Zweck: Browsen, Vergleichen, Daten-Konvertierung, Bearbeiten, Suchen, Arbeitet mit: Datenbanken