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[ Quellcode: loki  ]

Paket: loki (2.4.7.4-4)

MCMC Linkage-Analyse auf allgemeine Stammbäume

Führt eine »multipoint linkage«-Analyse im Markov-Kette-Monte-Carlo-Verfahren für große, komplexe Stammbäume durch. Das aktuelle Paket unterstützt nur Analysen von quantitativen Merkmalen, allerdings wird diese Beschränkung in späteren Versionen aufgehoben werden. Die zusammengeführte Abschätzung der QTL-Anzahl, -Position und -Effekte nutzt »Reversible Jump«-MCMC. Es ist auch möglich, eine »affected only IBD sharing«-Analyse durchzuführen.

Die Homepage dieses Projektes war ursprünglich http://loki.homeunix.net, doch wird dieses Projekt von den Entwicklern nicht mehr betreut und deren Webseite ist verschwunden. Daher zeigt das Webseiten-Feld nun auf die entsprechende Seite im Webarchiv.

Markierungen: Feld: Biologie, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu loki

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc0.1 (>= 2.3.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • sug: loki-doc
    Postscript manual for loki

loki herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 419,5 kB944 kB [Liste der Dateien]
amd64 394,1 kB884 kB [Liste der Dateien]
armel 416,8 kB888 kB [Liste der Dateien]
avr32 (inoffizielle Portierung) 426,8 kB756 kB [Liste der Dateien]
hppa 408,9 kB844 kB [Liste der Dateien]
hurd-i386 363,3 kB844 kB [Liste der Dateien]
i386 353,5 kB812 kB [Liste der Dateien]
ia64 632,6 kB1796 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64 400,2 kB900 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-i386 353,2 kB800 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 325,1 kB800 kB [Liste der Dateien]
mips 446,3 kB1072 kB [Liste der Dateien]
mipsel 446,4 kB1072 kB [Liste der Dateien]
powerpc 402,4 kB880 kB [Liste der Dateien]
s390 387,6 kB836 kB [Liste der Dateien]
sparc 374,6 kB840 kB [Liste der Dateien]