[ Quellcode: lagan ]
Paket: lagan (2.0-10)
Links für lagan
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket lagan herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [lagan.stanford.edu]
Ähnliche Pakete:
highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.
Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.
Andere Pakete mit Bezug zu lagan
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- dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
lagan herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 178,8 kB | 1.898,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 179,9 kB | 834,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 170,4 kB | 1.770,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 163,2 kB | 691,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 162,4 kB | 583,0 kB | [Liste der Dateien] |
| hppa (inoffizielle Portierung) | 174,6 kB | 716,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 186,7 kB | 831,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 (inoffizielle Portierung) | 213,5 kB | 1.035,0 kB | [Liste der Dateien] |
| m68k (inoffizielle Portierung) | 155,6 kB | 683,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 182,3 kB | 1.924,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64 (inoffizielle Portierung) | 190,5 kB | 2.034,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 199,0 kB | 1.898,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 180,8 kB | 682,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 186,6 kB | 802,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sh4 (inoffizielle Portierung) | 179,3 kB | 1.747,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc64 (inoffizielle Portierung) | 166,3 kB | 23.868,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 174,9 kB | 796,0 kB | [Liste der Dateien] |