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[ Quellcode: gromacs  ]

Paket: gromacs (4.0.5-4 und andere)

Simulator für Moleküldynamik, Werkzeuge für das Erstellen der Modelle und deren Analyse

GROMACS ist ein vielseitiges Paket, um Molekulardynamik vorzuführen, z.B. um die Newtonschen Bewegungsgleichungen für Systeme mit Hunderten bis zu Millionen von Teilchen zu simulieren.

Es wurde primär für biochemische Moleküle wie Proteine und Fette entworfen, die eine Vielzahl von komplizierten kovalenten Wechselwirkungen aufweisen, aber da GROMACS die nicht-kovalenten Interaktionen (welche in Simulationen dominieren) extrem schnell berechnen kann, nutzen viele Gruppen es auch für Forschungen an nicht-biologischen Systemen, z.B. an Polymeren.

GROMACS bietet bei weitem zu viele Möglichkeiten um ihm mit einer kurzen Beschreibung gerecht werden zu können. Eine bessere Übersicht bietet <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, Chemie, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, X Window-System, Rolle: Programm, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: gromacs-data (= 4.0.4-1) [m68k]
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
    dep: gromacs-data (= 4.0.5-4) [nicht m68k]
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, mips, mipsel]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libfftw3-3
    Bibliothek für Schnelle Fourier-Transformationen (Fast Fourier Transform, FFT)
  • dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]
    Laufzeitbibliothek für GNU-Fortran-Anwendungen
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    X11-Inter-Client-Exchange-Bibliothek
  • dep: libsm6
    X11-Biblitothek für Sitzungsverwaltung
  • dep: libx11-6
    Clientseitige X11-Bibliothek
  • rec: cpp
    Der GNU C-Präprozessor (cpp)

gromacs herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 4.0.5-4 4 599,9 kB16480 kB [Liste der Dateien]
amd64 4.0.5-4 4 379,3 kB15608 kB [Liste der Dateien]
armel 4.0.5-4 4 775,8 kB17096 kB [Liste der Dateien]
hppa 4.0.5-4 4 311,2 kB17676 kB [Liste der Dateien]
i386 4.0.5-4 3 731,5 kB12556 kB [Liste der Dateien]
ia64 4.0.5-4 6 250,3 kB35332 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64 4.0.5-4 4 378,6 kB15544 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-i386 4.0.5-4 3 727,1 kB12640 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 4.0.4-1 3 808,6 kB12524 kB [Liste der Dateien]
mips 4.0.5-4 4 204,3 kB20460 kB [Liste der Dateien]
mipsel 4.0.5-4 4 166,1 kB20460 kB [Liste der Dateien]
powerpc 4.0.5-4 4 391,7 kB18336 kB [Liste der Dateien]
s390 4.0.5-4 4 337,4 kB14540 kB [Liste der Dateien]
sparc 4.0.5-4 4 027,2 kB16292 kB [Liste der Dateien]