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[ Quellcode: garlic  ]

Paket: garlic (1.6-1)

Ein Darstellungsprogramm für Biomoleküle

Garlic wurde zur Untersuchung von Membranproteinen geschrieben. Es kann dazu benutzt werden, andere Proteine sowie einige geometrische Objekte darzustellen. Diese Version von garlic erkennt das PDB-Format in der Version 2.1. Garlic kann auch dazu benutzt werden, Proteinsequenzen zu analysieren.

Es benötigt nur die X-Bibliotheken, keine anderen Bibliotheken werden gebraucht.

Enthaltene Fähigkeiten: 

 - Die Position und Dicke der Scheiben sind in einem kleinen Fenster
   sichtbar.
 - Atombindungen und Atome werden als unabhängige, zeichenbare Objekte
   behandelt.
 - Die Farben der Atome und Bindungen hängen von ihrer Position ab. Fünf
   Abbildungsmodi sind verfügbar (wie für die Scheiben).
 - Ist in der Lage, Stereobilder anzuzeigen.
 - Ist in der Lage, andere geometrische Objekte, wie z.B. Membranen,
   anzuzeigen.
 - Atomare Information ist für ein mit dem Mauszeiger bedecktes Atom
   verfügbar. Kein Klick wird benötigt, einfach den Mauszeiger über
   die Struktur bewegen.
 - Ist in der Lage, mehr als eine Struktur zu laden.
 - Ist in der Lage, Ramachandran-Plots, Helixräder, Venn-Diagramme,
   durchschnittliche Hydrophobie und Plots des hydrophoben Moments zu
   zeichnen.
 - Die Eingabeaufforderung ist am unteren Rand des Hauptfensters
   verfügbar. Sie ist in der Lage, eine Fehlermeldung und einen Befehl
   anzuzeigen.

Markierungen: Feld: Biologie, Chemie, Benutzer-Schnittstellen: X Window-System, Rolle: Programm, Scope: Hilfswerkzeug, Zweck: Daten-Visualisierung, X Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu garlic

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • dep: libx11-6
    Clientseitige X11-Bibliothek
  • sug: garlic-doc
    [Chemistry] a molecular visualization program - documents
  • sug: openbabel
    Umwandeln und Verändern von Dateien mit chemischen Daten

garlic herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 319,9 kB1136 kB [Liste der Dateien]
amd64 265,3 kB952 kB [Liste der Dateien]
arm 251,9 kB892 kB [Liste der Dateien]
armel 278,9 kB968 kB [Liste der Dateien]
hppa 270,1 kB912 kB [Liste der Dateien]
hurd-i386 233,5 kB900 kB [Liste der Dateien]
i386 236,1 kB916 kB [Liste der Dateien]
ia64 376,2 kB1564 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64 (inoffizielle Portierung) 264,2 kB850 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-i386 (inoffizielle Portierung) 233,6 kB802 kB [Liste der Dateien]
m68k 206,7 kB828 kB [Liste der Dateien]
mips 285,7 kB1092 kB [Liste der Dateien]
mipsel 284,9 kB1092 kB [Liste der Dateien]
powerpc 264,0 kB932 kB [Liste der Dateien]
s390 232,5 kB856 kB [Liste der Dateien]
sparc 240,0 kB912 kB [Liste der Dateien]