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[ Quellcode: dialign  ]

Paket: dialign (2.2.1-3)

Segmentbasierte Ausrichtung mehrerer Sequenzen

DIALIGN2 ist ein Konsolen-Werkzeug für die Ausrichtung mehrerer Protein- oder DNA-Sequenzen. Es erstellt Ausrichtungen ausgehend von lückenlosen Paaren ähnlicher Sequenzsegmente. Dieses Bewertungsverfahren ist der grundlegende Unterschied zwischen DIALIGN und anderen globalen oder lokalen Methoden für Sequenzausrichtungen. DIALIGN nutzt keinerlei »gap penalties« (Negativbewertungen für Lücken). Es wurde publiziert von B. Morgenstern in Bioinformatics 15(3):211-218 (1999).

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Vergleichen, Unterstützt Formate: Reiner Text

Andere Pakete mit Bezug zu dialign

  • hängt ab von
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  • schlägt vor
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

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Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 208,4 kB640 kB [Liste der Dateien]
amd64 201,8 kB612 kB [Liste der Dateien]
armel 203,8 kB612 kB [Liste der Dateien]
avr32 (inoffizielle Portierung) 206,3 kB612 kB [Liste der Dateien]
hppa 205,4 kB616 kB [Liste der Dateien]
hurd-i386 197,4 kB604 kB [Liste der Dateien]
i386 199,5 kB608 kB [Liste der Dateien]
ia64 227,9 kB716 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-amd64 203,1 kB598 kB [Liste der Dateien]
kfreebsd-i386 198,3 kB592 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 192,0 kB596 kB [Liste der Dateien]
mips 206,5 kB640 kB [Liste der Dateien]
mipsel 206,6 kB640 kB [Liste der Dateien]
powerpc 204,3 kB616 kB [Liste der Dateien]
s390 201,6 kB608 kB [Liste der Dateien]
sparc 201,0 kB612 kB [Liste der Dateien]