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[ Quellcode: clustalx  ]

Paket: clustalx (1.83-4 und andere) [non-free]

GUI for Clustal W

This package offers a GUI interface for the Clustal W multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.

The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.

An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.

Markierungen: Biologie: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Nukleinsäuren, Proteine, Feld: Biologie, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: X Window-System, Rolle: Programm, Scope: Hilfswerkzeug, Interface Toolkit: Lesstif/Motif, Zweck: Analyse, Vergleichen, Daten-Visualisierung, Unterstützt Formate: Reiner Text, X Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu clustalx

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: clustalw [m68k]
    global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
  • dep: lesstif1 [m68k]
    Paket nicht verfügbar
  • dep: lesstif2 [nicht m68k]
    Unter LGPL freigegebene OSF/Motif 2.1-Implementation
  • dep: libc6 (>= 2.3.1-1) [m68k]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht alpha, ia64, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • dep: libncbi6 (>= 6.1.20030421)
    NCBI Bibliotheken für Biologie Anwendungen
  • dep: libvibrant6 (>= 6.1.20030421) [m68k]
    Paket nicht verfügbar
  • dep: libvibrant6a (>= 6.1.20060507) [nicht m68k]
    NCBI-Bibliotheken für graphische Biologieanwendungen
  • dep: libx11-6 [nicht m68k]
    Clientseitige X11-Bibliothek
  • dep: libxmu6 [nicht m68k]
    X11-Bibliothek mit diversen Hilfsprogrammen
  • dep: libxt6 [nicht m68k]
    X11 Toolkit-Grundlagen Bibliothek
  • dep: xlibs (>> 4.1.0) [m68k]
    Paket nicht verfügbar
  • sug: boxshade
    Pretty-printing von multiplen Sequenzalignments
  • sug: texshade
    Paket nicht verfügbar
    oder texlive-latex-extra
    TeX Live: LaTeX supplementary packages

clustalx herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 1.83-4 271,5 kB812 kB [Liste der Dateien]
amd64 1.83-4 242,9 kB700 kB [Liste der Dateien]
arm 1.83-4 235,4 kB684 kB [Liste der Dateien]
hppa 1.83-4 248,8 kB708 kB [Liste der Dateien]
i386 1.83-4 223,5 kB684 kB [Liste der Dateien]
ia64 1.83-4 324,3 kB1076 kB [Liste der Dateien]
m68k 1.83-1 196,1 kB600 kB [Liste der Dateien]
mips 1.83-4 253,9 kB808 kB [Liste der Dateien]
mipsel 1.83-4 258,8 kB824 kB [Liste der Dateien]
powerpc 1.83-4 246,4 kB720 kB [Liste der Dateien]
s390 1.83-4 238,3 kB704 kB [Liste der Dateien]
sparc 1.83-4 231,2 kB688 kB [Liste der Dateien]