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[ Quellcode: openbabel  ]

Paket: openbabel (2.2.0-2)

Chemiekastenwerkzeuge

Open Babel ist ein Chemiekasten, konzipiert, um die vielen Sprachen chemischer Daten zu sprechen. Es erlaubt die Suche, Konvertierung, Analyse oder Speicherung von Daten aus der molekularen Modellierung, Chemie, Festkörpermaterialien, Biochemie oder ähnlichen Gebieten. Einige Eigenschaften: 

 * Anheften und Entfernen von Wasserstoff
 * Unterstützung für molekulare Mechanik
 * Unterstützung für SMARTS molekulare Abgleichsyntax
 * Automatische Erkennung und Anzeige der Eigenschaften (Ringe,
   Bindungen, Hybridisierung, Aromatizität)
 * Flexible Atomzuordnung und Erkennung von multiplen Verbindungen
   der Atomkoordinaten
 * Berechnung der Partialladung nach Gasteiger-Marsili

Open Babels Dateiformatunterstützung umfasst: PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL, Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC und MPQC.

Dieses Paket enthält die folgenden Werkzeuge: 

 * babel: Konverter zwischen verschiedenen Chemiedateiformaten
 * obenergy: Berechnet die Energie einzelner Moleküle
 * ebminimize: Optimiert die Geometrie eines Moleküls so, dass die
   Energie minimal wird
 * obgrep: SMARTS-Muster verwendendes Molekül Suchprogramm
 * obprop: Gibt die standard Moleküleigenschaften aus
 * obfit: Überlagert zwei Moleküle anhand eines Musters
 * obrotamer: Generiert Konformere/Rotamer-Koordinaten
 * obchiral: Gibt die Chiralität von Molekülen aus
 * obrotate: Rotiert den Raumwinkel der Moleküle, im Batch-Betrieb

Markierungen: Feld: Chemie, Implementiert in: C++, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: Daten-Konvertierung

Andere Pakete mit Bezug zu openbabel

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht alpha, ia64]
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [nicht arm, armel, hppa]
    GCC Support-Bibliothek
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    GCC Support-Bibliothek
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [nicht armel]
    Die GNU stdc++-Bibliothek (Version 3)
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms zur Laufzeit
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

openbabel herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 222,4 kB596 kB [Liste der Dateien]
amd64 222,3 kB580 kB [Liste der Dateien]
arm 219,9 kB524 kB [Liste der Dateien]
armel 210,6 kB516 kB [Liste der Dateien]
hppa 224,5 kB540 kB [Liste der Dateien]
i386 217,4 kB528 kB [Liste der Dateien]
ia64 246,0 kB704 kB [Liste der Dateien]
mips 214,5 kB560 kB [Liste der Dateien]
mipsel 217,4 kB560 kB [Liste der Dateien]
powerpc 242,6 kB616 kB [Liste der Dateien]
s390 218,8 kB528 kB [Liste der Dateien]
sparc 217,7 kB528 kB [Liste der Dateien]