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Paket: gromacs (3.3.3-2)

Simulator für Moleküldynamik, Werkzeuge für das Erstellen der Modelle und deren Analyse

GROMACS ist ein vielseitiges Paket, um Molekulardynamik vorzuführen, z.B. um die Newtonschen Bewegungsgleichungen für Systeme mit Hunderten bis zu Millionen von Teilchen zu simulieren.

Es wurde primär für biochemische Moleküle wie Proteine und Fette entworfen, die eine Vielzahl von komplizierten kovalenten Wechselwirkungen aufweisen, aber da GROMACS die nicht-kovalenten Interaktionen (welche in Simulationen dominieren) extrem schnell berechnen kann, nutzen viele Gruppen es auch für Forschungen an nicht-biologischen Systemen, z.B. an Polymeren.

GROMACS bietet bei weitem zu viele Möglichkeiten um ihm mit einer kurzen Beschreibung gerecht werden zu können. Eine bessere Übersicht bietet <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Markierungen: Feld: Biologie, Strukturelle Biologie, Chemie, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, X Window-System, Rolle: Programm, GUI-Baukasten: X-Bibliothek, X Window-System: Anwendung

Andere Pakete mit Bezug zu gromacs

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: base-files (>= 4.0.1)
    Verschiedene Dateien für das Basis-System von Debian
  • dep: gromacs-data (= 3.3.3-2)
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
  • dep: lesstif2
    Unter LGPL freigegebene OSF/Motif 2.1-Implementation
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [nicht alpha, ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    GNU C-Bibliothek: Dynamische Bibliotheken
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
  • dep: libfftw3-3
    Bibliothek für Schnelle Fourier-Transformationen (Fast Fourier Transform, FFT)
  • dep: libgfortran3 [alpha]
    Laufzeitbibliothek für GNU-Fortran-Anwendungen
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    X11-Inter-Client-Exchange-Bibliothek
  • dep: libsm6
    X11-Biblitothek für Sitzungsverwaltung
  • dep: libx11-6
    Clientseitige X11-Bibliothek
  • dep: libxext6
    X11-Bibliothek für verschiedene Erweiterungen
  • dep: libxp6
    Clientbibliothek für X Printing Extension (Xprint)
  • dep: libxt6
    X11 Toolkit-Grundlagen Bibliothek
  • rec: cpp
    Der GNU C-Präprozessor (cpp)

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Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha 7 219,6 kB13844 kB [Liste der Dateien]
amd64 6 389,2 kB14660 kB [Liste der Dateien]
arm 6 100,3 kB12152 kB [Liste der Dateien]
armel 4 339,4 kB14964 kB [Liste der Dateien]
hppa 7 340,7 kB13188 kB [Liste der Dateien]
i386 5 529,8 kB13840 kB [Liste der Dateien]
ia64 10 306,6 kB24512 kB [Liste der Dateien]
mips 7 422,0 kB15016 kB [Liste der Dateien]
mipsel 7 398,4 kB14976 kB [Liste der Dateien]
powerpc 5 017,3 kB11644 kB [Liste der Dateien]
s390 6 163,3 kB12520 kB [Liste der Dateien]
sparc 6 577,6 kB13416 kB [Liste der Dateien]