Paket: sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Quellcode: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Andere Pakete mit Bezug zu sniffles

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

sniffles herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	703,3 kB	1.100,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	681,9 kB	1.040,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	674,2 kB	1.027,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	680,5 kB	899,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	717,0 kB	1.127,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	680,8 kB	1.166,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	682,9 kB	1.147,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	707,2 kB	1.196,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	679,3 kB	1.100,0 kB	[Liste der Dateien]