Paket: hmmer2 (2.3.2+dfsg-7)

[ Quellcode: hmmer2  ]

Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse

HMMER ist eine Implementierung der Profile-Hidden-Markov-Modelle für eine sensitive Suche in biologischen Sequenzdatenbanken mit multiplen Sequenzalignments als Anfragen.

Mit einem multiplen Sequenzalignment als Eingabe baut HMMER ein statistisches Modell, genannt »Hidden-Markov-Modell«. Mit diesem kann in Sequenzdatenbanken nach homologen Sequenzen gesucht werden. Dabei können gleichzeitig, der gesuchten Proteinfamilie zugehörige, Sequenzen alignt werden.

Andere Pakete mit Bezug zu hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libsquid1 (>= 1.9g+cvs20050121)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  Hilfsprogramme für die biologische Sequenzanalyse

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-7)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
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arm64	280,1 kB	2.009,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	271,6 kB	2.030,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	271,9 kB	1.610,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	316,4 kB	2.490,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	308,3 kB	2.357,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	305,0 kB	2.262,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	310,9 kB	2.968,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	292,8 kB	2.233,0 kB	[Liste der Dateien]