Paket: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3)

[ Quellcode: pbsim  ]

simulator for PacBio sequencing reads

PacBio DNA sequencers produce two types of characteristic reads: CCS (short and low error rate) and CLR (long and high error rate), both of which could be useful for de novo assembly of genomes. PBSIM simulates those PacBio reads from a reference sequence by using either a model-based or sampling-based simulation. Simulated reads are useful, for example, when developing or evaluating sequence assemblers targeted at PacBio data.

Markierungen: Biologie: Nukleinsäuren, Feld: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rolle: Programm, Zweck: use::simulating, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu pbsim

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	24,9 kB	100,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	24,1 kB	120,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	24,5 kB	91,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	23,9 kB	83,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	25,8 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	25,4 kB	122,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	25,8 kB	121,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	27,1 kB	120,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	23,6 kB	92,0 kB	[Liste der Dateien]