Package: autodock (4.2.3-2)

[ Source: autodocksuite  ]

analyse af ligand-binding til proteinstruktur

AutoDock er en iøjnefaldende repræsentation for programmer der adresserer simuleringen af dokningen af ret små kemiske ligander til ret så store proteinreceptorer. Tidligere versioner havde hele fleksibiliteten i liganderne mens proteinet blev holdt ret så rigidt. Denne seneste version 4 tillader også fleksibilitet for valgte sidekæder for overfladeefterladenskaber, dvs., tage rotamerne i betragtning.

Programmet AutoDock udfører dokning af liganden til et gittersæt der beskriver målproteinet. AutoGrid forhåndsberegner disse gitre.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Other Packages Related to autodock

• dep: libc6 (>= 2.6)

  Indlejret GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• sug: autodocktools

  GUI to help set up, launch and analyze AutoDock dockings

• sug: autogrid

  beregn på forhånd liganders binding til deres receptor

Download autodock

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc	189.5 kB	456.0 kB	[list of files]