Package: hmmer (3.0-4)

Links for hmmer

Debian Resources:

Download Source Package hmmer:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Matthew Vernon (QA Page)
Nelson A. de Oliveira (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Eric Talevich (QA Page)

External Resources:

Homepage [hmmer.janelia.org]

Similar packages:

Markovy modely pro analýzu proteinových sekvencí

HMMER je implementací Markovy metody pro hledání biologických sekvencí pomocí vícenásobných sekvenčních uspořádání.

Na základě vstupu, HMMER vytvoří statistický model nazývaný "skrytý Markovův model", který je možno použití pro vytvoření dotazů do databáze sekvencí a pro nalezení (a/nebo uspořádání) dodatečných souhlasných rodin.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Databases

Other Packages Related to hmmer

depends

recommends

suggests

dep: libc0.1 (>= 2.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc0.1-udeb
dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.4) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x, sparc]

dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
dep: libc6.1 (>= 2.3.4) [ia64]

Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

Knihovna pro překladač GCC

sug: hmmer-doc (>= 3.0-4)

profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

Download hmmer

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,165.0 kB	4,615.0 kB	[list of files]
armel	1,886.7 kB	3,876.0 kB	[list of files]
armhf	1,657.2 kB	2,652.0 kB	[list of files]
i386	2,165.5 kB	4,748.0 kB	[list of files]
ia64	3,087.4 kB	9,014.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	2,165.2 kB	4,584.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	2,165.4 kB	4,716.0 kB	[list of files]
mips	1,893.1 kB	4,431.0 kB	[list of files]
mipsel	1,913.6 kB	4,447.0 kB	[list of files]
powerpc	1,921.7 kB	4,116.0 kB	[list of files]
s390	1,969.2 kB	4,198.0 kB	[list of files]
s390x	2,041.0 kB	4,633.0 kB	[list of files]
sparc	1,801.8 kB	3,899.0 kB	[list of files]