Package: gromacs (4.5.5-1)

[ Source: gromacs  ]

Simulátor molekulární dynamiky, s nástroji pro sestavování a analýzu

GROMACS je víceúčelový balíček pro molekulární dynamiku, tedy simulace pohybu podle Newtonovských rovnic na systémech stovek až milionů částic.

Je primárně navržen pro biochemické molekuly jako jsou bílkoviny nebo lipidy, které mají mnoho komplikovaných vazebních interakcí, ale protože je GROMACS velmi rychlý i při počítání nevazebních interakcí (které většinou dominují v simulaci) je používán i pro výzkum nebiologických systémů, např. polymerů.

GROMACS nabízí příliš mnoho vlastností na to, aby je krátký popis mohl spravedlivě vyjmenovat. Kompletní seznam je na adrese <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, field::chemistry, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::x11, role::program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Other Packages Related to gromacs

• dep: gromacs-data (= 4.5.5-1)

  GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libfftw3-3

  Knihovna pro výpočty Fast Fourierových transformací

• dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

  Knihovna pro překladač GCC

• dep: libx11-6

  Knihovna klientské části X11

• dep: libxml2 (>= 2.7.4)

  GNOME XML knihovna

• rec: cpp

  GNU C preprocessor (cpp)

Download gromacs

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	5,789.4 kB	14,388.0 kB	[list of files]
armel	5,792.0 kB	12,600.0 kB	[list of files]
armhf	6,801.3 kB	11,737.0 kB	[list of files]
i386	5,419.6 kB	13,384.0 kB	[list of files]
ia64	8,525.8 kB	25,808.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	5,764.6 kB	14,084.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	5,368.1 kB	13,416.0 kB	[list of files]
mips	5,457.6 kB	12,488.0 kB	[list of files]
mipsel	5,466.0 kB	12,484.0 kB	[list of files]
powerpc	5,456.2 kB	11,416.0 kB	[list of files]
s390	5,432.3 kB	11,640.0 kB	[list of files]
s390x	8,133.8 kB	17,810.0 kB	[list of files]
sparc	5,440.1 kB	11,280.0 kB	[list of files]