Package: boxshade (3.3.1-6)

[ Source: boxshade  ]

Pěkný tisk vícesekvenčních uspořádání

Boxshade je program sloužící k vytváření pěkně vypadajících tiskových sestav z různých uspořádání proteinů a sekvencí DNA. Program neřeší vlastní uspořádání a vyžaduje vstupní soubor, který je vytvořen tímto programem či ručně upraven příslušnými nástroji.

Boxshade čte sekvenční uspořádání ze souborů PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data a ESEE-save (omezených na maximálně 150 sekvencí s maximálně 10000 položkami). Program umí různá stínování na stejné/podobné zbytky. Výstup je možno zobrazovat na obrazovce ve formátech: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT a HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, biology::peptidic, field::biology, Field: Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to boxshade

• dep: libc0.1 (>= 2.7) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [not ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, s390x]

• dep: libc6.1 (>= 2.7) [ia64]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• sug: kalign

  Globální a progresivní nastavení seskupení

  or clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  or mafft

  Program pro uspořádání aminokyselin a sekvencí nukleotidů

  or hmmer

  Markovy modely pro analýzu proteinových sekvencí

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX supplementary packages

• sug: xfig

  Prostředek pro interaktivní generování obrázků pod X11

Download boxshade

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	52.1 kB	165.0 kB	[list of files]
armel	53.4 kB	163.0 kB	[list of files]
armhf	47.7 kB	147.0 kB	[list of files]
i386	48.8 kB	160.0 kB	[list of files]
ia64	68.2 kB	258.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	52.3 kB	119.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	48.6 kB	114.0 kB	[list of files]
mips	48.6 kB	176.0 kB	[list of files]
mipsel	49.1 kB	176.0 kB	[list of files]
powerpc	50.7 kB	167.0 kB	[list of files]
s390	53.8 kB	171.0 kB	[list of files]
s390x	55.8 kB	179.0 kB	[list of files]
sparc	49.1 kB	163.0 kB	[list of files]