Package: autodock (4.2.3-2)

[ Source: autodocksuite  ]

Analyzátor uspořádání ligand proteinových struktur

AutoDock je prvním typickým programem provádějícím simulace uspořádání malých chemických ligand do větších receptorů bílkovin. U předchozích verzí byl kladen důraz především na ligandy než na proteiny. Poslední verze 4 používá k uspořádání vybraných řetězců také určité pružnosti, např. bere v potaz tzv. rotamery.

Program AutoDock provádí uspořádání ligand do množin popisujících cílový protein. AutoGrid vypočítává právě tyto uspořádání.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Other Packages Related to autodock

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.13) [s390x]

  dep: libc6 (>= 2.2) [mips, mipsel]

  dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [not armel, armhf]

  Knihovna pro překladač GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [not armel, armhf]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel, armhf]

• dep: libunwind7 [ia64]

  Knihovna pro interpretaci volaných řetězů programu - běhová

• sug: autodocktools

  GUI to help set up, launch and analyze AutoDock dockings

• sug: autogrid

  Předvýpočty vazby ligandu k receptoru

Download autodock

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	182.0 kB	464.0 kB	[list of files]
armel	183.3 kB	436.0 kB	[list of files]
armhf	164.5 kB	324.0 kB	[list of files]
i386	164.6 kB	448.0 kB	[list of files]
ia64	283.0 kB	960.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	182.1 kB	458.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	165.3 kB	442.0 kB	[list of files]
mips	185.0 kB	476.0 kB	[list of files]
mipsel	186.3 kB	476.0 kB	[list of files]
powerpc	186.0 kB	436.0 kB	[list of files]
s390	171.0 kB	424.0 kB	[list of files]
s390x	181.7 kB	438.0 kB	[list of files]
sparc	189.5 kB	456.0 kB	[list of files]