[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: openbabel  ]

Package: openbabel (2.2.3-1 and others)

Sada chemických nástrojů

Open Babel jsou chemické nástroje, které umí pracovat s různými chemickými daty. Program vám umožní vyhledávat, převádět, analyzovat, ukládat data z modelů molekul, chemie, pevných materiálů, biochemie a podobných oblastí. Mezi jeho vlastnosti patří: 

 * Přidávání a mazání vodíku
 * Podpora molekulární mechaniky
 * Podpora syntaxe SMARTS
 * Automatické operace (kruhy, vazby, hybridizace, aromaticita)
 * Flexibilní typizace atomů a vnímání vícenásobných vazeb uspořádání atomu
 * Výpočty Gasteiger-Marsili

Souborový formát Open Babel podporuje PDB, XYZ, CIF, CML, SMILES, MDL Molfile, ChemDraw, Gaussian, GAMESS, MOPAC a MPQC.

Tento balíček obsahuje následující nástroje: 

 * babel: Převádí mezi různými formáty chemických souborů
 * obenergy: Vypočítává energii molekul
 * obminimize: Optimalizace geometrie, minimalizace energie molekuly
 * obgrep: Vyhledávání molekul pomocí šablony SMARTS
 * obprop: Tiskne vlastnosti standardních molekul
 * obfit: Navrší dvě molekuly podle jejich šablony
 * obrotamer: Generuje souřadnice řídící/pořadí
 * obchiral: Vytiskne informace molekulové chirality
 * obrotate: Otočí kontaktní úhel molekul v dávkovém módu

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Data Conversion

Other Packages Related to openbabel

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips, mipsel]
    dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [not armel, hppa]
    Knihovna pro překladač GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]
    Knihovna pro překladač GCC
  • dep: libopenbabel3
    Chemical toolbox library
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [not armel]
    GNU Standard C++ knihovna verze 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Knihovna pro interpretaci volaných řetězů programu - běhová
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    komprimační knihovna - runtime

Download openbabel

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 2.2.3-1 122.7 kB480 kB [list of files]
armel 2.2.3-1+b1 111.5 kB420 kB [list of files]
hppa 2.2.3-1 124.1 kB444 kB [list of files]
i386 2.2.3-1 118.1 kB428 kB [list of files]
ia64 2.2.3-1+b1 146.3 kB604 kB [list of files]
mips 2.2.3-1 117.5 kB464 kB [list of files]
mipsel 2.2.3-1 117.1 kB464 kB [list of files]
powerpc 2.2.3-1 138.1 kB508 kB [list of files]
s390 2.2.3-1 119.0 kB432 kB [list of files]
sparc 2.2.3-1 118.8 kB428 kB [list of files]