Package: rasmol (2.7.5.2-1 and others)

[ Source: rasmol  ]

Vizualizace makromolekul pro potřeby biologie

RasMole je grafický molekulární program určený k vizualizaci proteinů, nukleových kyselin a malých molekul. Program je určen k jejich zobrazení, k výukovým účelům a vytváření obrázků s kvalitou srovnatelnou s publikacemi.

Tento program čte soubor s koordinnáty molekuly a interaktivně zobrazuje molekulu na obrazovce v různých barevných schématech a reprezentacích. V současné době reprezentace obsahují "depth-cued wireframes", 'Dreiding' sticks, vyplnění prostoru sfér (CPK), "ball and stick, solid and strand biomolecular ribbons," a konečně i popisy atomů a tečkované povrchy.

Mezi podporované vstupní formáty patří PDB (Protein Data Bank), MDL (Tripos Associates' Alchemy and Sybyl Mol2 formats, Molecular Design Limited - formát Mol), Minnesota Supercomputer Center's (MSC) XYZ (XMol), formát CHARMm, CIF a mmCIF.

Tento balíček nainstaluje dvě verze RashMol, rasmol-gtk má modernější rozhraní GTK a rasmol-classic používající starší rozhraní Xlib.

Tags: Field: Chemistry, User Interface: X Window System, Role: Program, Scope: scope::utility, uitoolkit::gtk, Purpose: Learning, Data Visualization, X Window System: Application

Other Packages Related to rasmol

• dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4) [not avr32, hppa, m68k]

  ATK accessibility toolkit

  dep: libatk1.0-0 (>= 1.20.0) [avr32, m68k]

  dep: libatk1.0-0 (>= 1.29.3) [hppa]

• dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc0.1-udeb

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa, powerpcspe]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.13) [s390x, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, mips, mipsel, powerpc, s390]

  dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]

  dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

  dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]

• dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]

  Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  2D vektorová grafická knihovna Cairo

• dep: libcbf0

  shared library supporting CBFlib

• dep: libcvector2 [not m68k]

  ANSI C implementation of dynamic arrays

• dep: libfontconfig1 (>= 2.4.0) [avr32, m68k]

  Všeobecná knihovna pro nastavení písma - běhová část

  dep: libfontconfig1 (>= 2.8.0) [not avr32, m68k]

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  Engine písma FreeType 2, soubory sdílené knihovny

• dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0) [not avr32, hppa, m68k]

  GDK Pixbuf library

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.16.0) [avr32, m68k]

  GLib library of C routines

  dep: libglib2.0-0 (>= 2.24.0) [not avr32, m68k]

• dep: libgtk2.0-0 (>= 2.12.0)

  GTK+ graphical user interface library

• dep: libpango1.0-0 (>= 1.14.0)

  Formátování a vykreslování mezinárodního textu

• dep: libvte9 (>= 1:0.16.9) [m68k]

  Terminal emulator widget for GTK+ 2.0 - runtime files

  dep: libvte9 (>= 1:0.20.4) [avr32]

  dep: libvte9 (>= 1:0.24.0) [not avr32, m68k]

• dep: libx11-6

  Knihovna klientské části X11

• dep: libxext6

  X11 miscellaneous extension library

• dep: libxft2 (>> 2.1.1) [m68k]

  X knihovna na kreslení fontů založená na FreeType

• dep: libxi6

  X11 Input extension library

• sug: rasmol-doc

  Documentation for rasmol

Download rasmol

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.7.5.2-1	1,834.1 kB	4,218.0 kB	[list of files]
amd64	2.7.5.2-1	1,637.9 kB	3,645.0 kB	[list of files]
armel	2.7.5.2-1	1,666.8 kB	3,644.0 kB	[list of files]
armhf	2.7.5.2-1	1,462.5 kB	2,628.0 kB	[list of files]
avr32 (unofficial port)	2.7.5-1	1,604.1 kB	2,988.0 kB	[list of files]
hppa	2.7.5-2	1,660.6 kB	3,552.0 kB	[list of files]
i386	2.7.5.2-1	1,458.4 kB	3,427.0 kB	[list of files]
ia64	2.7.5.2-1	2,512.4 kB	8,054.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	2.7.5.2-1	1,639.4 kB	3,582.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	2.7.5.2-1	1,458.6 kB	3,361.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.7.4.2-5	1,116.8 kB	2,932.0 kB	[list of files]
mips	2.7.5.2-1	1,614.4 kB	3,656.0 kB	[list of files]
mipsel	2.7.5.2-1	1,629.2 kB	3,656.0 kB	[list of files]
powerpc	2.7.5.2-1	1,626.3 kB	3,362.0 kB	[list of files]
powerpcspe (unofficial port)	2.7.5-3	1,654.5 kB	3,524.0 kB	[list of files]
s390	2.7.5.2-1	1,535.2 kB	3,322.0 kB	[list of files]
s390x	2.7.5.2-1	1,664.9 kB	3,788.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.7.5.2-1	1,690.0 kB	3,385.0 kB	[list of files]
sparc	2.7.5.2-1	1,616.9 kB	3,438.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.7.5-3	1,667.8 kB	3,502.0 kB	[list of files]