[  sarge  ] [  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: rasmol  ]

Package: rasmol (2.7.4.2-3 and others)

Vizualizace makromolekul pro potřeby biologie

RasMole je grafický molekulární program určený k vizualizaci proteinů, nukleových kyselin a malých molekul. Program je určen k jejich zobrazení, k výukovým účelům a vytváření obrázků s kvalitou srovnatelnou s publikacemi.

Tento program čte soubor s koordinnáty molekuly a interaktivně zobrazuje molekulu na obrazovce v různých barevných schématech a reprezentacích. V současné době reprezentace obsahují "depth-cued wireframes", 'Dreiding' sticks, vyplnění prostoru sfér (CPK), "ball and stick, solid and strand biomolecular ribbons," a konečně i popisy atomů a tečkované povrchy.

Mezi podporované vstupní formáty patří PDB (Protein Data Bank), MDL (Tripos Associates' Alchemy and Sybyl Mol2 formats, Molecular Design Limited - formát Mol), Minnesota Supercomputer Center's (MSC) XYZ (XMol), formát CHARMm, CIF a mmCIF.

Tento balíček nainstaluje dvě verze RashMol, rasmol-gtk má modernější rozhraní GTK a rasmol-classic používající starší rozhraní Xlib.

Tags: Field: Chemistry, User Interface: X Window System, Role: Program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: Data Visualization, X Window System: Application

Other Packages Related to rasmol

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libatk1.0-0 (>= 1.20.0)
    The ATK accessibility toolkit
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libcairo2 (>= 1.2.4)
    The Cairo 2D vector graphics library
  • dep: libcbf0
    shared library supporting CBFlib
  • dep: libfontconfig1 (>= 2.4.0)
    generic font configuration library - runtime
  • dep: libfreetype6 (>= 2.3.5)
    FreeType 2 font engine, shared library files
  • dep: libglib2.0-0 (>= 2.16.0)
    The GLib library of C routines
  • dep: libgtk2.0-0 (>= 2.12.0)
    The GTK+ graphical user interface library
  • dep: libpango1.0-0 (>= 1.20.3)
    Layout and rendering of internationalized text
  • dep: libvte9 (>= 1:0.16.9)
    Terminal emulator widget for GTK+ 2.0 - runtime files
  • dep: libx11-6
    X11 client-side library
  • dep: libxext6
    X11 miscellaneous extension library
  • dep: libxft2 (>> 2.1.1)
    FreeType-based font drawing library for X
  • dep: libxi6
    X11 Input extension library
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    komprimační knihovna - runtime

Download rasmol

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 2.7.4.2-3 1,574.7 kB3748 kB [list of files]
amd64 2.7.4.2-3 1,461.3 kB3328 kB [list of files]
arm 2.7.4.2-3 1,460.5 kB3132 kB [list of files]
armel 2.7.4.2-3 1,530.0 kB3324 kB [list of files]
hppa 2.7.4.2-3+b1 1,516.2 kB3300 kB [list of files]
hurd-i386 2.7.4.2-3 1,284.0 kB3004 kB [list of files]
i386 2.7.4.2-3 1,282.8 kB3032 kB [list of files]
ia64 2.7.4.2-3 2,235.7 kB7364 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 2.7.4.2-3 1,460.7 kB3340 kB [list of files]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 2.7.4.2-3 1,283.1 kB3020 kB [list of files]
m68k 2.7.4.2-2 1,136.5 kB2944 kB [list of files]
mips 2.7.4.2-3+b1 1,550.7 kB3948 kB [list of files]
mipsel 2.7.4.2-3 1,556.1 kB3948 kB [list of files]
powerpc 2.7.4.2-3 1,464.4 kB3256 kB [list of files]
s390 2.7.4.2-3+b1 1,383.1 kB3056 kB [list of files]
sparc 2.7.4.2-3+b1 1,384.8 kB3212 kB [list of files]