Package: mipe (1.1-3)

Nástroje pro uložení dat PCR

MIPE pracuje se standardním formátem sloužícím k výměně a/nebo uložení všech informací asociovaných s experimenty PCR pomocí jednotného textového souboru. To je:

 * umožňuje výměnu dat PCR mezi výzkumníky/laboratořemi
 * umožňuje sledování dat
 * předchází problémům při odesílání dat do dbSTS nebo dbSNP
 * povoluje tvorbu standardních skriptů sloužících k rozbalení dat (např.
   seznamu slabik, pozic SNP nebo haplotypů různých zvířat)

Přestože se tento dat používá především pro uložení dat, je jeho primárním cílem výměna dat. Své uplatnění nalezne v rozsáhlejších repositářích, relačních databázích a především pro uložení těchto dat. Formát MIPE se pak používá jako standardní formát určený k importu do a/nebo exportu z těchto databází.

Publikace o MIPE: Aerts J & Veenendaal T. MIPE - a XML-format to facilitate the storage and exchange of PCR-related data. Online Journal of Bioinformatics 6(2): 114-120 (2005).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Molecular Biology, Implemented in: Perl, User Interface: Command Line, Role: Documentation, Program, Scope: Utility, Purpose: Data Organisation, Supports Format: XML