Package: hmmer (2.3.2-5 and others)

Links for hmmer

Debian Resources:

Download Source Package hmmer:

Maintainers:

Debian-Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Matthew Vernon (QA Page)
Nelson A. de Oliveira (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)

External Resources:

Homepage [hmmer.janelia.org]

Similar packages:

Markovy modely pro analýzu proteinových sekvencí

HMMER je implementací Markovy metody pro hledání biologických sekvencí pomocí vícenásobných sekvenčních uspořádání.

Na základě vstupu, HMMER vytvoří statistický model nazývaný "skrytý Markovův model", který je možno použití pro vytvoření dotazů do databáze sekvencí a pro nalezení (a/nebo uspořádání) dodatečných souhlasných rodin.

Tags: Biology: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Searching, Works with: Databases, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to hmmer

depends

recommends

suggests

dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc0.1-udeb
dep: libc0.3 (>= 2.2.4-4) [hurd-i386]

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc0.3-udeb
dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: libpvm3 [not hurd-i386]

Parallel Virtual Machine - shared libraries

rec: biosquid

Nástroje pro biologickou sekvenční analýzu

sug: hmmer-doc (>= 2.3.2-5)

profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)
sug: hmmer-pvm (>= 2.3.2-5)

HMMER programs with PVM (Parallel Virtual Machine) support

Download hmmer

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha	2.3.2-5	1,345.2 kB	3080 kB	[list of files]
amd64	2.3.2-5	1,191.2 kB	2512 kB	[list of files]
armel	2.3.2-5	1,120.2 kB	2280 kB	[list of files]
hppa	2.3.2-5	1,216.0 kB	2344 kB	[list of files]
hurd-i386	2.1.4	1,589.9 kB	6872 kB	[list of files]
i386	2.3.2-5	1,075.6 kB	2264 kB	[list of files]
ia64	2.3.2-5	1,916.9 kB	5340 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	2.3.2-5	1,190.1 kB	2618 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	2.3.2-5	1,069.7 kB	2362 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.3.2-5	905.1 kB	2080 kB	[list of files]
mips	2.3.2-5	1,225.8 kB	3052 kB	[list of files]
mipsel	2.3.2-5	1,230.7 kB	3052 kB	[list of files]
powerpc	2.3.2-5	1,214.9 kB	2588 kB	[list of files]
s390	2.3.2-5	1,139.9 kB	2368 kB	[list of files]
sparc	2.3.2-5	1,069.2 kB	2272 kB	[list of files]