[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: gromacs  ]

Package: gromacs (4.0.5-4 and others)

Simulátor molekulární dynamiky, s nástroji pro sestavování a analýzu

GROMACS je víceúčelový balíček pro molekulární dynamiku, tedy simulace pohybu podle Newtonovských rovnic na systémech stovek až milionů částic.

Je primárně navržen pro biochemické molekuly jako jsou bílkoviny nebo lipidy, které mají mnoho komplikovaných vazebních interakcí, ale protože je GROMACS velmi rychlý i při počítání nevazebních interakcí (které většinou dominují v simulaci) je používán i pro výzkum nebiologických systémů, např. polymerů.

GROMACS nabízí příliš mnoho vlastností na to, aby je krátký popis mohl spravedlivě vyjmenovat. Kompletní seznam je na adrese <http://www.gromacs.org/content/view/12/176/>.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Chemistry, Implemented in: C, User Interface: Command Line, X Window System, Role: Program, Interface Toolkit: X library, X Window System: Application

Other Packages Related to gromacs

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: gromacs-data (= 4.0.4-1) [m68k]
    GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
    dep: gromacs-data (= 4.0.5-4) [not m68k]
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3) [amd64, hppa, mips, mipsel]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3) [ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libfftw3-3
    library for computing Fast Fourier Transforms
  • dep: libgfortran3 (>= 4.3) [alpha]
    Runtime library for GNU Fortran applications
  • dep: libgsl0ldbl (>= 1.9)
    GNU Scientific Library (GSL) -- library package
  • dep: libice6 (>= 1:1.0.0)
    Knihovna X11 Inter-Client Exchange
  • dep: libsm6
    X11 Session Management library
  • dep: libx11-6
    Knihovna klientské části X11
  • rec: cpp
    GNU C preprocesor (cpp)

Download gromacs

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 4.0.5-4 4,599.9 kB16480 kB [list of files]
amd64 4.0.5-4 4,379.3 kB15608 kB [list of files]
armel 4.0.5-4 4,775.8 kB17096 kB [list of files]
hppa 4.0.5-4 4,311.2 kB17676 kB [list of files]
i386 4.0.5-4 3,731.5 kB12556 kB [list of files]
ia64 4.0.5-4 6,250.3 kB35332 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 4.0.5-4 4,378.6 kB15544 kB [list of files]
kfreebsd-i386 4.0.5-4 3,727.1 kB12640 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 4.0.4-1 3,808.6 kB12524 kB [list of files]
mips 4.0.5-4 4,204.3 kB20460 kB [list of files]
mipsel 4.0.5-4 4,166.1 kB20460 kB [list of files]
powerpc 4.0.5-4 4,391.7 kB18336 kB [list of files]
s390 4.0.5-4 4,337.4 kB14540 kB [list of files]
sparc 4.0.5-4 4,027.2 kB16292 kB [list of files]