[  lenny  ] [  sid  ]
[ Source: emboss  ]

Package: emboss (5.0.0-7)

EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite)

EMBOSS je svobodný software s otevřeným kódem, který byl vytvořen s ohledem na potřeby molekulární biologie (např. EMBnet). Program automaticky převádí data různých formátů a tak vám umožní transparentní příjem dat z webu. Také, díky knihovnám obsaženým v tomto balíčku, se jedná o platformu, která umožní ostatním vědcům vytvářet a vydávat programy v duchu open source. EMBOSS integruje řadu balíčků a nástrojů určených k sekvenční analýze. EMBOSS porušuje historický trend používání komerčních programů.

Reference o EMBOSS: Rice,P. Longden,I. and Bleasby,A. "EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite" Trends in Genetics June 2000, vol 16, No 6. pp.276-277

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: Data Conversion, Searching, Data Visualization, Works with: Databases, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to emboss

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: csh
    Shell se syntaxí podobnou C, výchozí login shell na systémech BSD
    or c-shell
    Shell se syntaxí podobnou C, výchozí login shell na systémech BSD virtual package provided by csh, tcsh
  • dep: emboss-data (= 5.0.0-7)
    Data files for the EMBOSS package
  • dep: emboss-lib
    EMBOSS Libraries
  • dep: libajax5
    EMBOSS library for commands
  • dep: libc0.1 (>= 2.7-1) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libfreetype6 (>= 2.3.5)
    FreeType 2 font engine, shared library files
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [armel]
    Knihovna pro překladač GCC
  • dep: libgd2-noxpm (>= 2.0.36~rc1~dfsg)
    GD Graphics Library version 2 (without XPM support)
    or libgd2-xpm (>= 2.0.36~rc1~dfsg)
    GD Graphics Library version 2
  • dep: libjpeg62
    The Independent JPEG Group's JPEG runtime library
  • dep: libnucleus5
    EMBOSS library for molecular sequence analysis
  • dep: libpng12-0 (>= 1.2.13-4)
    PNG library - runtime
  • dep: libx11-6
    X11 client-side library
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    komprimační knihovna - runtime
  • rec: dialign
    Segment-based multiple sequence alignment
  • rec: primer3
    Tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification
  • sug: clustalw
    global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
  • sug: embassy
    Package not available
  • sug: emboss-doc
    Documentation for EMBOSS

Download emboss

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 853.5 kB3732 kB [list of files]
amd64 786.3 kB3384 kB [list of files]
arm 798.3 kB2892 kB [list of files]
armel 838.1 kB3112 kB [list of files]
hppa 836.8 kB3176 kB [list of files]
i386 780.8 kB2908 kB [list of files]
ia64 1,003.2 kB4724 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 (unofficial port) 790.6 kB2818 kB [list of files]
kfreebsd-i386 (unofficial port) 782.1 kB2310 kB [list of files]
m68k 788.3 kB2924 kB [list of files]
mips 790.9 kB3300 kB [list of files]
mipsel 797.8 kB3300 kB [list of files]
powerpc 1,054.1 kB4080 kB [list of files]
s390 834.8 kB3172 kB [list of files]
sparc 811.2 kB3048 kB [list of files]