[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: dialign  ]

Package: dialign (2.2.1-3)

Segmentové multisekvenční uspořádání

DIALIGN2 je nástroj příkazové řádky, který provádí mnohonásobné uspořádání sekvence DNA. Program vytváří uspořádání z párů si odpovídajících částí sekvencí. Skórovací schéma pro uspořádání je základním rozdílem mezi DIALIGN a dalšími globálními nebo lokálními metodami uspořádání. Pamatujte, že DIALIGN nevyužívá žádného druhu penalt za vzniklé mezery. Byl vydán B. Morgensternem v Bioinformatice, březen 1999, 15(3):211-8.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Comparing, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to dialign

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]
    Embedded GNU C Library: Shared libraries
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Embedded GNU C Library: Shared libraries
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb

Download dialign

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 208.4 kB640 kB [list of files]
amd64 201.8 kB612 kB [list of files]
armel 203.8 kB612 kB [list of files]
avr32 (unofficial port) 206.3 kB612 kB [list of files]
hppa 205.4 kB616 kB [list of files]
hurd-i386 197.4 kB604 kB [list of files]
i386 199.5 kB608 kB [list of files]
ia64 227.9 kB716 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 203.1 kB598 kB [list of files]
kfreebsd-i386 198.3 kB592 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 192.0 kB596 kB [list of files]
mips 206.5 kB640 kB [list of files]
mipsel 206.6 kB640 kB [list of files]
powerpc 204.3 kB616 kB [list of files]
s390 201.6 kB608 kB [list of files]
sparc 201.0 kB612 kB [list of files]