[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: ncbi-tools6  ]

Package: blast2 (1:2.2.21.20090809-1 and others)

Základní nástroj pro vyhledávání uspořádání

Slavný sekvenční program pro uspořádání. Toto je "oficiální" verze NCBI, #2. Blastall umožňuje získat nukleotid či proteinové sekvence. Ke srovnání používá databázi a konečný výsledek je vrácen zpět uživateli.

Pamatujte, že databáze nejsou obsaženy v Debianu; musíte si je stáhnout ručně.

Tags: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Searching

Other Packages Related to blast2

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.3.2) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.9) [hurd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.3.2) [amd64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armel, mips, mipsel, powerpc, s390]
    dep: libc6 (>= 2.5) [avr32, hppa]
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
  • dep: libc6.1 (>= 2.3.2) [ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
    dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel]
    Knihovna pro překladač GCC
  • dep: libncbi6 (<< 6.1.20080302.1) [m68k]
    NCBI libraries for biology applications
    dep: libncbi6 (<< 6.1.20090809.1) [not m68k]
    dep: libncbi6 (>= 6.1.20080302) [m68k]
    dep: libncbi6 (>= 6.1.20090809) [not m68k]
  • sug: libvibrant6a
    NCBI libraries for graphic biology applications
  • sug: ncbi-rrna-data [not m68k]
    large rRNA BLAST databases distributed with the NCBI toolkit
  • sug: ncbi-tools-bin
    Knihovny NCBI pro biologické aplikace (textové nástroje)
  • sug: ncbi-tools-x11
    Knihovny NCBI pro biologické aplikace (nástroje X)

Download blast2

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 1:2.2.21.20090809-1 658.5 kB1472 kB [list of files]
amd64 1:2.2.21.20090809-1 647.1 kB1298 kB [list of files]
armel 1:2.2.21.20090809-1+b1 629.0 kB1280 kB [list of files]
avr32 (unofficial port) 1:2.2.21.20090809-1 614.0 kB1176 kB [list of files]
hppa 1:2.2.21.20090809-1 641.4 kB1276 kB [list of files]
hurd-i386 1:2.2.21.20090809-1 581.1 kB1176 kB [list of files]
i386 1:2.2.21.20090809-1 623.3 kB1256 kB [list of files]
ia64 1:2.2.21.20090809-1+b1 725.8 kB1708 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 1:2.2.21.20090809-1 640.3 kB1268 kB [list of files]
kfreebsd-i386 1:2.2.21.20090809-1 619.4 kB1174 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 1:2.2.18.20080302-4 615.3 kB1224 kB [list of files]
mips 1:2.2.21.20090809-1 632.1 kB1340 kB [list of files]
mipsel 1:2.2.21.20090809-1 623.0 kB1340 kB [list of files]
powerpc 1:2.2.21.20090809-1 666.6 kB1404 kB [list of files]
s390 1:2.2.21.20090809-1 652.6 kB1316 kB [list of files]
sparc 1:2.2.21.20090809-1 634.2 kB1272 kB [list of files]