Package: autodock (4.2.3-2 and others)

Links for autodock

Debian Resources:

Download Source Package autodocksuite:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Nelson A. de Oliveira (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [autodock.scripps.edu]

Similar packages:

Analyzátor uspořádání ligand proteinových struktur

AutoDock je prvním typickým programem provádějícím simulace uspořádání malých chemických ligand do větších receptorů bílkovin. U předchozích verzí byl kladen důraz především na ligandy než na proteiny. Poslední verze 4 používá k uspořádání vybraných řetězců také určité pružnosti, např. bere v potaz tzv. rotamery.

Program AutoDock provádí uspořádání ligand do množin popisujících cílový protein. AutoGrid vypočítává právě tyto uspořádání.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Other Packages Related to autodock

depends

recommends

suggests

dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]

Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc0.1-udeb
dep: libc0.3 (>= 2.2.6) [hurd-i386]

Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc0.3-udeb
dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]

Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.10) [hppa]

dep: libc6 (>= 2.13) [s390x, sh4]

dep: libc6 (>= 2.2) [mips, mipsel, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, powerpc, powerpcspe, s390]

dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]

dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]

dep: libc6 (>= 2.6) [sparc]
dep: libc6.1 (>= 2.2) [ia64]

Vestavěná knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libgcc1 [powerpcspe]

Knihovna pro překladač GCC

dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1) [not armel, armhf, avr32, hppa, hurd-i386, m68k, powerpcspe]

dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [avr32]

dep: libgcc1 (>= 1:4.4.0) [armel, armhf]

dep: libgcc1 (>= 4.2.1) [hurd-i386]
dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

Knihovna pro překladač GCC
dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

Knihovna pro překladač GCC
dep: libstdc++6 [powerpcspe]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [not armel, armhf, avr32, powerpcspe]

dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [avr32]

dep: libstdc++6 (>= 4.4.0) [armel, armhf]
dep: libunwind7 [ia64]

Knihovna pro interpretaci volaných řetězů programu - běhová

sug: autodocktools

GUI to help set up, launch and analyze AutoDock dockings
sug: autogrid

Předvýpočty vazby ligandu k receptoru

Download autodock

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	4.2.3-2	214.4 kB	544.0 kB	[list of files]
amd64	4.2.3-2	182.0 kB	464.0 kB	[list of files]
armel	4.2.3-2	183.3 kB	436.0 kB	[list of files]
armhf	4.2.3-2	164.5 kB	324.0 kB	[list of files]
avr32 (unofficial port)	4.2.3-1	183.2 kB	404.0 kB	[list of files]
hppa	4.2.3-1	206.7 kB	484.0 kB	[list of files]
hurd-i386	4.2.3-2+b1	165.5 kB	420.0 kB	[list of files]
i386	4.2.3-2	164.6 kB	448.0 kB	[list of files]
ia64	4.2.3-2	283.0 kB	960.0 kB	[list of files]
kfreebsd-amd64	4.2.3-2	182.1 kB	458.0 kB	[list of files]
kfreebsd-i386	4.2.3-2	165.3 kB	442.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	4.2.1+rc1-2	133.4 kB	388.0 kB	[list of files]
mips	4.2.3-2	185.0 kB	476.0 kB	[list of files]
mipsel	4.2.3-2	186.3 kB	476.0 kB	[list of files]
powerpc	4.2.3-2	186.0 kB	436.0 kB	[list of files]
powerpcspe (unofficial port)	4.2.3-2	205.7 kB	488.0 kB	[list of files]
s390	4.2.3-2	171.0 kB	424.0 kB	[list of files]
s390x	4.2.3-2	181.7 kB	438.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	4.2.3-2	206.0 kB	448.0 kB	[list of files]
sparc	4.2.3-2	189.5 kB	456.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	4.2.3-2	196.2 kB	488.0 kB	[list of files]