Download Source Package apbs:
APBS je softwarový balíček pro numerické řešení Poisson-Boltzmannovy rovnice (PBE), jednoho z nejpopulárnějších modelů kontinua sloužícího k popisu elektrostatických iterací mezi molekulami rozpuštěnými ve slaném vodním roztoku. Elektrostatické kontinuum hraje velmi důležitou roli v různých oblastech biomolekulárních simulací, včetně:
* simulací difúzního procesu pro určení kinetických vztahů ligand-protein
a protein-protein,
* implicitní řešitel molekulární dynamiky biomolekul,
* řešení energetických výpočtů sloužících ke stanovení rovnovážných
konstant vazeb ligand-protein a protein-protein, jejichž hodnota je
důležitá při vytváření léků
* a biomolekulární titrační studie.
APBS byl vytvořen tak, aby efektivně vyhodnotil elektrostatické vlastnosti v takových simulacích, které pokrývají rozsáhlé studie zaměřené na výzkum molekul ve vztahu k desítkám miliónů atomů.
|
|
|
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| alpha | 5,015.2 kB | 6768 kB | [list of files] |
| amd64 | 4,928.4 kB | 6864 kB | [list of files] |
| arm | 5,018.7 kB | 6796 kB | [list of files] |
| armel | 5,057.5 kB | 6972 kB | [list of files] |
| hppa | 4,994.1 kB | 6776 kB | [list of files] |
| i386 | 4,865.2 kB | 6668 kB | [list of files] |
| ia64 | 5,259.9 kB | 7708 kB | [list of files] |
| kfreebsd-amd64 (unofficial port) | 4,920.6 kB | 6548 kB | [list of files] |
| kfreebsd-i386 (unofficial port) | 4,857.1 kB | 6340 kB | [list of files] |
| m68k | 4,844.1 kB | 6640 kB | [list of files] |
| mips | 5,087.2 kB | 6944 kB | [list of files] |
| mipsel | 5,087.3 kB | 6944 kB | [list of files] |
| powerpc | 4,993.8 kB | 6712 kB | [list of files] |
| s390 | 4,926.2 kB | 6652 kB | [list of files] |
| sparc | 4,916.4 kB | 6676 kB | [list of files] |