[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: amap-align  ]

Package: amap-align (2.2-1)

Uspořádání sekvence proteinů

AMAP je nástroj příkazové řádky, který provede různá uspořádání sekvence peptidů. Využívá pozdějšího dekódování a sekvenčního uspořádání, místo tradiční progresivní metody uspořádání. Jedná se o jediný program, který vám umožní ovládat citlivost/specifikaci změn. Je založen na zdrojovém kódu ProbCons, ale používá přesnou metriku uspořádání a přitom eliminuje konzistenční transformace.

Vizualizační nástroj AMAP 2.2 (java) není dosud součástí Debianu.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C++, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Comparing, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to amap-align

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc0.1 (>= 2.3) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.1-udeb
  • dep: libc0.3 (>= 2.7-1) [hurd-i386]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc0.3-udeb
  • dep: libc6 (>= 2.5) [avr32]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.5-5) [m68k]
    dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, avr32, hurd-i386, ia64, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not armel, avr32, hppa, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386, m68k]
    Knihovna pro překladač GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [avr32, hurd-i386]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [armel]
    dep: libgcc1 (>= 1:4.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libgcc2 (>= 4.2.1-1) [m68k]
    Package not available
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    Knihovna pro překladač GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.2.1) [avr32, hurd-i386]
    GNU Standard C++ knihovna verze 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.2.1-4) [not armel, avr32, hurd-i386, kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
    dep: libstdc++6 (>= 4.4) [kfreebsd-amd64, kfreebsd-i386]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Knihovna pro interpretaci volaných řetězů programu - běhová

Download amap-align

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 162.6 kB356 kB [list of files]
amd64 135.6 kB324 kB [list of files]
armel 130.7 kB304 kB [list of files]
avr32 (unofficial port) 144.9 kB284 kB [list of files]
hppa 157.9 kB328 kB [list of files]
hurd-i386 122.8 kB300 kB [list of files]
i386 124.4 kB256 kB [list of files]
ia64 222.6 kB568 kB [list of files]
kfreebsd-amd64 142.6 kB336 kB [list of files]
kfreebsd-i386 122.9 kB288 kB [list of files]
m68k (unofficial port) 112.3 kB296 kB [list of files]
mips 155.7 kB384 kB [list of files]
mipsel 156.4 kB384 kB [list of files]
powerpc 149.5 kB316 kB [list of files]
s390 125.1 kB304 kB [list of files]
sparc 131.5 kB316 kB [list of files]