[  etch  ] [  etch-m68k  ] [  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: rasmol  ]

Package: rasmol (2.7.4.2-3 and others)

Vizualizace makromolekul pro potřeby biologie

RasMole je grafický molekulární program určený k vizualizaci proteinů, nukleových kyselin a malých molekul. Program je určen k jejich zobrazení, k výukovým účelům a vytváření obrázků s kvalitou srovnatelnou s publikacemi.

Tento program čte soubor s koordinnáty molekuly a interaktivně zobrazuje molekulu na obrazovce v různých barevných schématech a reprezentacích. V současné době reprezentace obsahují "depth-cued wireframes", 'Dreiding' sticks, vyplnění prostoru sfér (CPK), "ball and stick, solid and strand biomolecular ribbons," a konečně i popisy atomů a tečkované povrchy.

Mezi podporované vstupní formáty patří PDB (Protein Data Bank), MDL (Tripos Associates' Alchemy and Sybyl Mol2 formats, Molecular Design Limited - formát Mol), Minnesota Supercomputer Center's (MSC) XYZ (XMol), formát CHARMm, CIF a mmCIF.

Tento balíček nainstaluje dvě verze RashMol, rasmol-gtk má modernější rozhraní GTK a rasmol-classic používající starší rozhraní Xlib.

Tags: Field: Chemistry, User Interface: X Window System, Role: Program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: Learning, Data Visualization, X Window System: Application

Other Packages Related to rasmol

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libatk1.0-0 (>= 1.20.0)
    Sada nástrojů pro přístupnost ATK
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libcairo2 (>= 1.2.4)
    The Cairo 2D vector graphics library
  • dep: libcbf0
    shared library supporting CBFlib
  • dep: libfontconfig1 (>= 2.4.0)
    Všeobecná knihovna pro nastavení písma - běhová část
  • dep: libfreetype6 (>= 2.3.5)
    Systém pro práci s fonty FreeType 2, soubory sdílené knihovny
  • dep: libglib2.0-0 (>= 2.16.0)
    Knihovna GLib s C rutinami
  • dep: libgtk2.0-0 (>= 2.12.0)
    Knihovna grafického uživatelského rozhraní GTK+
  • dep: libpango1.0-0 (>= 1.20.3)
    Formátování a vykreslování mezinárodního textu
  • dep: libvte9 (>= 1:0.16.9)
    Ovládací prvek (widget) emulátor terminálu pro GTK+ 2.0 - běhové soubory
  • dep: libx11-6
    Knihovna klientské části X11
  • dep: libxext6
    Různorodé rozšiřující knihovny X11
  • dep: libxft2 (>> 2.1.1)
    X knihovna na kreslení fontů založená na FreeType
  • dep: libxi6
    X11 Input extension library
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    komprimační knihovna - runtime

Download rasmol

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha 2.7.4.2-3 1,574.7 kB3748 kB [list of files]
amd64 2.7.4.2-3 1,461.3 kB3328 kB [list of files]
arm 2.7.4.2-3 1,460.5 kB3132 kB [list of files]
armel 2.7.4.2-3 1,530.0 kB3324 kB [list of files]
hppa 2.7.4.2-3+b1 1,516.2 kB3300 kB [list of files]
i386 2.7.4.2-3 1,282.8 kB3032 kB [list of files]
ia64 2.7.4.2-3 2,235.7 kB7364 kB [list of files]
mips 2.7.4.2-3+b1 1,550.7 kB3948 kB [list of files]
mipsel 2.7.4.2-3 1,556.1 kB3948 kB [list of files]
powerpc 2.7.4.2-3 1,464.4 kB3256 kB [list of files]
s390 2.7.4.2-3+b1 1,383.1 kB3056 kB [list of files]
sparc 2.7.4.2-3+b1 1,384.8 kB3212 kB [list of files]