Package: boxshade (3.3.1-3)

Links for boxshade

Debian Resources:

Download Source Package boxshade:

Maintainers:

Debian-Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
David Paleino (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.ch.embnet.org]

Similar packages:

Pěkný tisk vícesekvenčních uspořádání

Boxshade je program sloužící k vytváření pěkně vypadajících tiskových sestav z různých uspořádání proteinů a sekvencí DNA. Program neřeší vlastní uspořádání a vyžaduje vstupní soubor, který je vytvořen tímto programem či ručně upraven příslušnými nástroji.

Boxshade čte sekvenční uspořádání ze souborů PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data a ESEE-save (omezených na maximálně 150 sekvencí s maximálně 10000 položkami). Program umí různá stínování na stejné/podobné zbytky. Výstup je možno zobrazovat na obrazovce ve formátech: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT a HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Nucleic Acids, Proteins, Software Development: Prettyprint, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Typesetting, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Plain Text, PostScript, TeX and LaTeX

Other Packages Related to boxshade

depends

recommends

suggests

dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64]

GNU C Library: Shared libraries
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

GNU C Library: Shared libraries
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

sug: kalign

Globální a progresivní nastavení seskupení

or clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

or mafft

Program pro uspořádání aminokyselin a sekvencí nukleotidů

or hmmer

Markovy modely pro analýzu proteinových sekvencí
sug: seaview

Multiple sequence alignment editor
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX supplementary packages
sug: xfig

Prostředek pro interaktivní generování obrázků pod X11

Download boxshade

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha	54.8 kB	268.0 kB	[list of files]
amd64	51.0 kB	244.0 kB	[list of files]
arm	49.2 kB	236.0 kB	[list of files]
armel	51.4 kB	240.0 kB	[list of files]
hppa	53.1 kB	248.0 kB	[list of files]
i386	44.9 kB	232.0 kB	[list of files]
ia64	65.8 kB	332.0 kB	[list of files]
mips	52.2 kB	284.0 kB	[list of files]
mipsel	52.4 kB	284.0 kB	[list of files]
powerpc	50.5 kB	248.0 kB	[list of files]
s390	51.6 kB	248.0 kB	[list of files]
sparc	48.2 kB	240.0 kB	[list of files]