Package: autodock (4.0.1-3)

[ Source: autodocksuite  ]

Analyzátor uspořádání ligand proteinových struktur

AutoDock je prvním typickým programem provádějícím simulace uspořádání malých chemických ligand do větších receptorů bílkovin. U předchozích verzí byl kladen důraz především na ligandy než na proteiny. Poslední verze 4 používá k uspořádání vybraných řetězců také určité pružnosti, např. bere v potaz tzv. rotamery.

Program AutoDock provádí uspořádání ligand do množin popisujících cílový protein. AutoGrid vypočítává právě tyto uspořádání.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Works with: 3D Model

Other Packages Related to autodock

• dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not arm, armel, hppa]

  Knihovna pro překladač GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]

  Knihovna pro překladač GCC

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [not armel]

  Knihovna GNU Standard C++ Library verze 3

  dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]

• dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]

  Knihovna pro interpretaci volaných řetězů programu - běhová

• rec: autogrid

  Předvýpočty vazby ligandu k receptoru

Download autodock

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha	1,494.0 kB	1,884.0 kB	[list of files]
amd64	1,468.0 kB	1,820.0 kB	[list of files]
arm	1,479.0 kB	1,816.0 kB	[list of files]
armel	1,475.5 kB	1,812.0 kB	[list of files]
hppa	1,496.3 kB	1,848.0 kB	[list of files]
i386	1,449.7 kB	1,733.0 kB	[list of files]
ia64	1,570.5 kB	2,228.0 kB	[list of files]
mips	1,501.0 kB	1,952.0 kB	[list of files]
mipsel	1,499.5 kB	1,964.0 kB	[list of files]
powerpc	1,476.0 kB	1,820.0 kB	[list of files]
s390	1,460.7 kB	1,792.0 kB	[list of files]
sparc	1,470.4 kB	1,832.0 kB	[list of files]