[  lenny  ] [  squeeze  ] [  sid  ]
[ Source: autodocksuite  ]

Package: autodock (4.0.1-3)

Analýza uspořádání ligand podle struktury proteinu

AutoDock je základní program simulující uspořádání malých chemických ligand a větších receptorů proteinů. V předchozí verzi byla všechna pružnost zaměřena na ligandy zatímco proteiny byly trochu více členité. Tato poslední verze 4 klade také důraz na pružnost v postranních řetězcích residua, např. podle potřeby převádí rotamery.

Program AutoDock se stará o umístění ligand do mřížky popisující cílovou bílkovinu. AutoGrid před-počítá právě tyto mřížky.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, Works with: 3D Model

Other Packages Related to autodock

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc6 (>= 2.7-1) [not alpha, ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6-udeb
  • dep: libc6.1 (>= 2.7-1) [alpha, ia64]
    Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
    also a virtual package provided by libc6.1-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:4.1.1-21) [not arm, armel, hppa]
    Knihovna pro překladač GCC
    dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [arm, armel]
  • dep: libgcc4 (>= 4.1.1-21) [hppa]
    Knihovna pro překladač GCC
  • dep: libstdc++6 (>= 4.1.1-21) [not armel]
    GNU Standard C++ knihovna verze 3
    dep: libstdc++6 (>= 4.3) [armel]
  • dep: libunwind7 (>= 0.98.5-6) [ia64]
    Knihovna pro interpretaci volaných řetězů programu - běhová
  • rec: autogrid
    Předvýpočty vazby ligandu k receptoru

Download autodock

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
alpha 1,494.0 kB1884 kB [list of files]
amd64 1,468.0 kB1820 kB [list of files]
arm 1,479.0 kB1816 kB [list of files]
armel 1,475.5 kB1812 kB [list of files]
hppa 1,496.3 kB1848 kB [list of files]
i386 1,449.7 kB1733 kB [list of files]
ia64 1,570.5 kB2228 kB [list of files]
mips 1,501.0 kB1952 kB [list of files]
mipsel 1,499.5 kB1964 kB [list of files]
powerpc 1,476.0 kB1820 kB [list of files]
s390 1,460.7 kB1792 kB [list of files]
sparc 1,470.4 kB1832 kB [list of files]