Пакет: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2 и други)

[ Източник: amap-align  ]

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Други пакети, свързани с amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27) [не alpha, ia64, riscv64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не armel, armhf, riscv64, s390x]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на amap-align

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	137,7 кБ	1 223,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	129,2 кБ	1 214,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	121,6 кБ	1 182,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106,8 кБ	1 174,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	107,2 кБ	1 118,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128,0 кБ	1 191,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	112,0 кБ	1 186,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	190,0 кБ	1 454,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106,8 кБ	1 190,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128,3 кБ	1 216,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	130,9 кБ	1 230,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	140,3 кБ	1 230,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134,2 кБ	1 156,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	109,2 кБ	1 202,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131,7 кБ	1 154,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	116,8 кБ	1 193,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131,0 кБ	1 210,0 кБ	[списък на файловете]